Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1cQ9D300 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms