Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms