Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chordc1Q9D1P4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms