Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd2Q9D1L0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd2Q9D1L0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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