Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan11Q9D1D1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms