Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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