Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms