Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms