Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms