Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm8Q9CZR4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms