Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssu72Q9CY97 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms