Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChtopQ9CY57 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms