Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exo5Q9CXP9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exo5Q9CXP9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms