Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms