Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Prdm5Q9CXE0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Prdm5Q9CXE0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Prdm5Q9CXE0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prdm5Q9CXE0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prdm5Q9CXE0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prdm5Q9CXE0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prdm5Q9CXE0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prdm5Q9CXE0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm5Q9CXE0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prdm5Q9CXE0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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