Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Utp23Q9CX11 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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