Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CWU4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CWU4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms