Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd12Q9CWU0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms