Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BccipQ9CWI3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms