Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud1Q9CUB6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Otud1Q9CUB6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Otud1Q9CUB6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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