Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a2Q9CTG6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms