Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sft2d3Q9CSV6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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