Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms