Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q9CRC3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9CRC3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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