Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms