Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znhit3Q9CQK1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znhit3Q9CQK1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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