Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE2

Tmem223, Transmembrane protein 223, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem223Q9CQE2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem223Q9CQE2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem223Q9CQE2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms