Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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