Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Rpl39lQ9CQD0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Rpl39lQ9CQD0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rpl39lQ9CQD0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rpl39lQ9CQD0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rpl39lQ9CQD0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rpl39lQ9CQD0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rpl39lQ9CQD0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl39lQ9CQD0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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