Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sar1bQ9CQC9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms