Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQC3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms