Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms