Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms