Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CPS8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms