Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrbp1Q99PL5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms