Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim3Q99PE5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms