Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GpnmbQ99P91 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms