Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NsmfQ99NF2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms