Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brms1Q99N20 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms