Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramel1Q99MW3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramel1Q99MW3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms