Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf17Q99MV7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf17Q99MV7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms