Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atp1b4Q99ME6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms