Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdpd3Q99LY2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms