Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms