Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp11Q99K46 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms