Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms