Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms