Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms