Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn1Q922Y1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn1Q922Y1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms