Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clip1Q922J3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms